짧은 생각을 말씀드리면
구성도나 흐름도를 그림으로 나타내어 연구노트에 기록하는 것과 동시에
코딩한 내용 중에 핵심 부분이나 주요 함수부는 코딩내용을 적어야 하지 않을까 싶습니다. (프린트 아웃해서 붙이는 한이 있더라도 )
프로그램 코딩이라는게 개인적인 취향이 강하게 작용하는 작업이라..
연구노트에 적힌 흐름도를 통해 같은 결과의 프로그램은 만들 수 있겠지만
전혀 다른 알고리즘으로 프로그램이 동작할 수도 있지 않을까 싶구요..
예를 들어
대학원생 한명이 연구실에서 졸업을 한 후에
같은 연구실의 후배가 선배의 연구노트를 보고 같은 실험을 한다고 할 때..
흐름도만 보고서 다시 코딩을 한다면..
결국 후배의 취향에 따라 선배와 전혀 다른 알고리즘의 코딩이 나올 수도 있을 것 같고 그럴 경우에는 처음에 목표했던 바가 아닌 다른 결과가 나올 수도 있지 않을까 싶어요.. ^^;;

연구노트를 작성하는 방법중 사진이나 그림등을 부착하는 방법이 있습니다. 부착한 다음 이것의 수정을 방지하기 위하여 총괄책임자의 사인이나 날인 그리고 날짜를 기입하기도 합니다. 그러나 이경우 노트가 매우 산만해 질 수도 있습니다.
질문하신 사항같은 경우는 관련내용을 출력하여 붙이는 방법이 좋을 듯 합니다. 그리고 코딩관련 데이트를 파일로 따로 보관하고 연구노트에는 간략한 출력물을 붙여서 날짜와 총괄책임자 사인 또는 날인을 하는게 좋을듯 합니다. 또한 이경우 비슷한 경우가 빈번이 발생할 것을 대비하여 파일(데이터, 시디 등)을 보관하는 곳을 별도로 만들어서 관리를 하며, 연구노트에 보관에관한 내용을 기입하여 찾기 쉽도록 리스트화 하는 것도 필요합니다.
보통 필름이나 사진, 시디 등의 자료를 이런식으로 별도로 보관하고 연구노트엔 관련내용을 출력해서 붙이는 형식으로 작성하는데 위 질문도 마찬가지로 하시면 될듯 합니다.^^

답변 감사드립니다. 앞으로 활발한 활동을 하겠습니다. 좋은 하루보내십시오.